Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SP140Q13342 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP140Q13342 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP140Q13342 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SP140Q13342 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP140Q13342 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP140Q13342 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SP140Q13342 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SP140Q13342 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP140Q13342 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SP140Q13342 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP140Q13342 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SP140Q13342 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SP140Q13342 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SP140Q13342 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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SP140Q13342 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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SP140Q13342 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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SP140Q13342 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP140Q13342 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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SP140Q13342 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP140Q13342 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP140Q13342 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP140Q13342 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP140Q13342 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP140Q13342 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP140Q13342 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP140Q13342 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP140Q13342 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP140Q13342 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SP140Q13342 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SP140Q13342 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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