Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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ERCC8Q13216 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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ERCC8Q13216 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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ERCC8Q13216 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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ERCC8Q13216 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ERCC8Q13216 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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