Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RESTQ13127 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RESTQ13127 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RESTQ13127 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RESTQ13127 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RESTQ13127 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RESTQ13127 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RESTQ13127 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RESTQ13127 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RESTQ13127 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RESTQ13127 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RESTQ13127 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RESTQ13127 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RESTQ13127 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RESTQ13127 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RESTQ13127 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RESTQ13127 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RESTQ13127 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RESTQ13127 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RESTQ13127 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RESTQ13127 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms