Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MKRN3Q13064 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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MKRN3Q13064 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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MKRN3Q13064 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MKRN3Q13064 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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