Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSPB3Q12988 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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