Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB40BQ12829 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RAB40BQ12829 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB40BQ12829 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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