Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIPAL4Q0D2K0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms