Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IFFO1Q0D2I5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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