Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD300CQ08708 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms