Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE4CQ08493 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE4CQ08493 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms