Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LGALS3BPQ08380 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms