Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TFF3Q07654 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms