Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL16A1Q07092 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL16A1Q07092 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms