Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FMODQ06828 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FMODQ06828 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FMODQ06828 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms