Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CENPCQ03188 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms