Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ARL9-201ENST00000360096 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 NIPA2P4-201ENST00000523928 1341 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CACNB1Q02641 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CLEC4C-205ENST00000542353 1314 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 HERC2P4-202ENST00000564145 683 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNB1Q02641 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms