Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A3Q01959 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A3Q01959 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms