Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPIBQ01892 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SPIBQ01892 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms