Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNA1DQ01668 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms