Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK16Q00536 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK16Q00536 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms