Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TFAMQ00059 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms