Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMF1P82094 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMF1P82094 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMF1P82094 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMF1P82094 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMF1P82094 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMF1P82094 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMF1P82094 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMF1P82094 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMF1P82094 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMF1P82094 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMF1P82094 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMF1P82094 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMF1P82094 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMF1P82094 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMF1P82094 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMF1P82094 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMF1P82094 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms