Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HBBP68871 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HBBP68871 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HBBP68871 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms