Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVPABLB-1P60509 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms