Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNU13P55769 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNU13P55769 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNU13P55769 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNU13P55769 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNU13P55769 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNU13P55769 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNU13P55769 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNU13P55769 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNU13P55769 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNU13P55769 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNU13P55769 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNU13P55769 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNU13P55769 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNU13P55769 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNU13P55769 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNU13P55769 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNU13P55769 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNU13P55769 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNU13P55769 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNU13P55769 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNU13P55769 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNU13P55769 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNU13P55769 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNU13P55769 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNU13P55769 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNU13P55769 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNU13P55769 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNU13P55769 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms