Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASP7P55210 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASP7P55210 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASP7P55210 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms