Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGGT1BP53609 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms