Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF135P52742 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms