Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TAF6P49848 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TAF6P49848 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TAF6P49848 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TAF6P49848 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms