Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRPC1P48995 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms