Protein–RNA interactions for Protein: P45973

CBX5, Chromobox protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX5P45973 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX5P45973 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX5P45973 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX5P45973 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX5P45973 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX5P45973 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX5P45973 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX5P45973 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX5P45973 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX5P45973 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX5P45973 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX5P45973 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CBX5P45973 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms