Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPOP42166 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMPOP42166 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPOP42166 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPOP42166 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPOP42166 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPOP42166 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPOP42166 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPOP42166 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPOP42166 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPOP42166 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMPOP42166 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMPOP42166 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms