Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM23P36406 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms