Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KDRP35968 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDRP35968 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDRP35968 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KDRP35968 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KDRP35968 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KDRP35968 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KDRP35968 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDRP35968 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDRP35968 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDRP35968 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDRP35968 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDRP35968 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDRP35968 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDRP35968 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDRP35968 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KDRP35968 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDRP35968 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDRP35968 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDRP35968 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDRP35968 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDRP35968 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDRP35968 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDRP35968 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDRP35968 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms