Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP6P35125 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
USP6P35125 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
USP6P35125 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP6P35125 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP6P35125 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
USP6P35125 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
USP6P35125 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP6P35125 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP6P35125 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP6P35125 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP6P35125 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP6P35125 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP6P35125 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP6P35125 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP6P35125 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP6P35125 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP6P35125 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP6P35125 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP6P35125 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP6P35125 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP6P35125 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP6P35125 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP6P35125 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP6P35125 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP6P35125 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP6P35125 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP6P35125 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP6P35125 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms