Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL4A5P29400 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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