Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2E1P29083 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms