Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRMP28827 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRMP28827 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
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