Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DUSP1P28562 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DUSP1P28562 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms