Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD10P28358 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD10P28358 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms