Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HTR2AP28223 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms