Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTAFRP25105 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms