Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRR1P24046 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms