Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NFYAP23511 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NFYAP23511 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NFYAP23511 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms