Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPRGP23470 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPRGP23470 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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