Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS6KB1P23443 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS6KB1P23443 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms