Protein–RNA interactions for Protein: P23280

CA6, Carbonic anhydrase 6, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA6P23280 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA6P23280 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA6P23280 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA6P23280 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA6P23280 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA6P23280 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CA6P23280 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CA6P23280 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CA6P23280 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA6P23280 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA6P23280 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA6P23280 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA6P23280 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA6P23280 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA6P23280 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA6P23280 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA6P23280 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA6P23280 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA6P23280 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA6P23280 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CA6P23280 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms