Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PRKACBP22694 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms