Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA1P20827 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms