Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRHP20396 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRHP20396 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRHP20396 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRHP20396 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRHP20396 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRHP20396 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRHP20396 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRHP20396 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRHP20396 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRHP20396 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRHP20396 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRHP20396 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRHP20396 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRHP20396 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRHP20396 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRHP20396 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TRHP20396 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRHP20396 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRHP20396 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRHP20396 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRHP20396 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRHP20396 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRHP20396 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRHP20396 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRHP20396 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRHP20396 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRHP20396 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRHP20396 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRHP20396 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRHP20396 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRHP20396 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRHP20396 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRHP20396 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRHP20396 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRHP20396 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRHP20396 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRHP20396 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRHP20396 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRHP20396 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRHP20396 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRHP20396 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRHP20396 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRHP20396 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRHP20396 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRHP20396 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRHP20396 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRHP20396 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRHP20396 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRHP20396 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRHP20396 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRHP20396 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRHP20396 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRHP20396 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRHP20396 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms